查看最新版本中的更新，您會(huì)注意到，Alphafold 3將其建模能力擴(kuò)展到更廣泛的分子結(jié)構(gòu)，例如配體（具有特定結(jié)合屬性的離子或分子），其他離子，以及所謂的“後經(jīng)斜率修飾”。

此外，AlphaFold 3還利用了更新的“配對(duì)器”體系結(jié)構(gòu)來(lái)處理配對(duì)關(guān)係（稍後再詳細(xì)介紹） - 在某些類(lèi)型的預(yù)測(cè)中提供增強(qiáng)的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性和更好的性能。您可以從NIH找到其他詳細(xì)信息。

最初的Alphafold系統(tǒng)贏得了諾貝爾獎(jiǎng)的創(chuàng)作者John Jumper和Demis Hassabis，這些工具繼續(xù)重塑了藥物發(fā)現(xiàn)的景觀(guān)。

實(shí)際應(yīng)用

那麼Alphafold如何協(xié)助主要的製藥公司？

與MIT有聯(lián)繫的勞倫·戴維斯（Lauren Davis）在討論其商業(yè)成功的一場(chǎng)演講中，讓我們了解瞭如何使用該技術(shù)來(lái)幫助開(kāi)發(fā)挽救生命的藥物。

戴維斯（Davis）強(qiáng)調(diào)了一個(gè)“變革性”過(guò)程，新工具可以在更有效的框架內(nèi)更快地開(kāi)發(fā)。她解釋說(shuō)，其中一個(gè)關(guān)鍵部分是目標(biāo)識(shí)別 - 預(yù)測(cè)特定目標(biāo)的結(jié)構(gòu)。這使公司能夠繞過(guò)一些昂貴和勞動(dòng)密集型的人類(lèi)和動(dòng)物測(cè)試階段，這些階段在道德上也很複雜。

她將系統(tǒng)比作約會(huì)應(yīng)用程序，在實(shí)際測(cè)試進(jìn)行之前，在該應(yīng)用程序進(jìn)行過(guò)濾之前，在進(jìn)行實(shí)際測(cè)試之前要過(guò)濾 - 類(lèi)似於在縮小選項(xiàng)（即投資時(shí)間和能源）後進(jìn)行日期。

她還討論了可能的抑製劑的評(píng)分，這是她覺(jué)得令人興奮的功能 - 尤其是因?yàn)樗?jīng)是麻省理工學(xué)院足球隊(duì)的一員。

總體而言，戴維斯說(shuō)明了Alphafold如何在真實(shí)的商業(yè)世界中發(fā)揮作用。

Alphafold 3開(kāi)源嗎？

這涵蓋了Alphafold對(duì)醫(yī)療領(lǐng)域的一些貢獻(xiàn)。

但是我想探索的新模型還有另一個(gè)方面，我收到了來(lái)自不同LLM模型的矛盾回復(fù)，所以讓我們深入研究：

如果您詢(xún)問(wèn)chatgpt是否是alphafold 3是開(kāi)源的，那麼這就是您得到的 - 至少根據(jù)我的經(jīng)驗(yàn)：

“（Alphafold 3 IS）不是開(kāi)源的；相反，可以通過(guò)DeepMind提供的基於雲(yún)的平臺(tái)用於非商業(yè)研究目的。這種方法引起了科學(xué)界對(duì)透明度和可訪(fǎng)問(wèn)性的關(guān)注。”

作為參考，該模型指向該有線(xiàn)文章。

但是，當(dāng)我從去年11月開(kāi)始審查了Dario Amodei的帖子時(shí)，我發(fā)現(xiàn)了一個(gè)簡(jiǎn)短但明確的聲明，表明Alphafold 3已成為開(kāi)源：

“ AI蛋白預(yù)測(cè)工具AlphaFold3是開(kāi)源的?！?/p>

當(dāng)我通過(guò)Bing搜索向Copilot提出相同的問(wèn)題時(shí)，回答是：

“不是完全開(kāi)源的 - Alphafold 3不是完全開(kāi)源的。雖然源代碼和模型權(quán)重可以在某些非商業(yè)限制下用於學(xué)術(shù)用途，但訪(fǎng)問(wèn)模型權(quán)重僅限於與學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)相關(guān)的人。這意味著研究人員可以將軟件用於非商業(yè)目的，但他們無(wú)法自由地訪(fǎng)問(wèn)商業(yè)應(yīng)用程序的培訓(xùn)權(quán)重?！?/p>

引用了幾個(gè)來(lái)源來(lái)支持這種觀(guān)點(diǎn)。

因此，基於所有這些信息，最可能的結(jié)論是Alphafold 3是“部分”開(kāi)源的 - 正如Copilot所說(shuō)，某些組件（例如權(quán)重）公開(kāi)可用，而另一些則仍然是專(zhuān)有的。

同時(shí)，Chatgpt認(rèn)為，託管Alphafold 3的基於雲(yún)的平臺(tái)“由DeepMind用於非商業(yè)研究目的”。

無(wú)論如何，我們不必在這裡推測(cè)：只需檢查GitHub頁(yè)面以獲取最新版本即可。

但是，這種情況表明，不同的AI模型如何對(duì)同一查詢(xún)提供不同的響應(yīng) - 我們必須學(xué)會(huì)導(dǎo)航。

做這項(xiàng)工作

無(wú)論如何，AlphaFold的更新版本繼續(xù)提供有力的藥物發(fā)現(xiàn)工具的遺產(chǎn)。戴維斯（Davis）在演講中引用了麗索普利（Lisinopril）作為ACE抑製劑，並解釋瞭如何應(yīng)用Alphafold來(lái)預(yù)測(cè)和建模抑製劑的行為。

實(shí)際上，數(shù)百萬(wàn)的美國(guó)人服用了類(lèi)似的藥物，這些藥物在廣泛的健康狀況中使用，從而使AI輔助發(fā)展具有很高的價(jià)值。

這會(huì)降低藥物成本嗎？這還有待觀(guān)察。

以上是Alphafold 3將建模能力擴(kuò)展到更多的生物學(xué)靶標(biāo)的詳細(xì)內(nèi)容。更多資訊請(qǐng)關(guān)注PHP中文網(wǎng)其他相關(guān)文章！